治療法は疾患によって異なります。甲状腺機能低下症は、多くの場合、合成甲状腺ホルモン補充療法で治療されます。甲状腺機能亢進症は、ホルモン産生を調節する抗甲状腺薬で治療されることがあります。また、甲状腺摘出術などの外科的介入が推奨される場合もあります。しかし、ヨウ素やセレンなどの適切な栄養摂取に加え、ストレス管理、定期的な運動、特定の物質（大豆やヨウ素の過剰摂取など）の過剰摂取を避けることも、甲状腺の健康維持に寄与します。.