Die Behandlungsmöglichkeiten hängen von der jeweiligen Erkrankung ab. Eine Schilddrüsenunterfunktion wird häufig mit einer synthetischen Schilddrüsenhormon-Ersatztherapie behandelt. Eine Schilddrüsenüberfunktion kann mit Schilddrüsenhemmern zur Regulierung der Hormonproduktion behandelt werden, und in manchen Fällen kann ein chirurgischer Eingriff wie die Schilddrüsenentfernung (Thyreoidektomie) empfohlen werden. Eine ausgewogene Ernährung, beispielsweise mit Jod und Selen, sowie Stressmanagement, regelmäßige Bewegung und der Verzicht auf übermäßigen Konsum bestimmter Substanzen (wie Soja und zu viel Jod) tragen ebenfalls zum allgemeinen Wohlbefinden der Schilddrüse bei.